| 機関 | 図書館・室 | 所在地 |
|---|---|---|
| 人間文化研究機構 国立民族学博物館 | みんぱく図書室 | 大阪府吹田市 |
| 人間文化研究機構 国際日本文化研究センター | 図書館 | 京都府京都市 |
| 人間文化研究機構 国立歴史民俗博物館 | 図書室 | 千葉県佐倉市 |
| 人間文化研究機構 国文学研究資料館 | 図書館 | 東京都立川市 |
| 人間文化研究機構 国立国語研究所 | 研究図書室 | 東京都立川市 |
| 人間文化研究機構 総合地球環境学研究所 | 図書室 | 京都府京都市 |
| 自然科学研究機構 分子科学研究所 | 岡崎情報図書館 | 愛知県岡崎市 |
| 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 | 岡崎情報図書館 | 愛知県岡崎市 |
| 自然科学研究機構 生理学研究所 | 岡崎情報図書館 | 愛知県岡崎市 |
| 自然科学研究機構 国立天文台 | 図書室 | 東京都三鷹市 |
| 自然科学研究機構 核融合科学研究所 | 図書館 | 岐阜県土岐市 |
| 宇宙航空研究開発機構 宇宙科学研究所 | 図書室 | 神奈川県相模原市 |
| 高エネルギー加速器研究機構 | 図書室・研究報告 | 茨城県つくば市 |
| 情報･システム研究機構 統計数理研究所 | 図書室 | 東京都立川市 |
| 情報･システム研究機構 国立極地研究所 | 情報図書室 | 東京都立川市 |
| 情報･システム研究機構 国立情報学研究所 | 図書室 | 東京都千代田区 |
| 情報･システム研究機構 国立遺伝学研究所 | 図書室 | 静岡県三島市 |